【ストーリー】

「名探偵コナン」（原作：青山剛昌）のTVシリーズ「漆黒の特急（ミステリートレイン）」を軸に、灰原哀の過去話と新規映像で再編した特別編集版。 科学者、宮野志保＜コードネーム シェリー＞として、黒ずくめの組織で毒薬を開発していた過去。組織を裏切り抜け出すために自身が開発したその毒薬を飲み幼児化、灰原哀と名乗り、同じ運命を背負ったコナンと出会う初登場回を始め、徐々にコナン達と距離を縮めていく様子や、姉である宮野明美との思い出が描かれた、灰原哀を語るのに必要不可欠なTVシリーズのエピソードにクローズアップする。