【ストーリー】

テレビアニメ化もされた堀越耕平による人気コミックの劇場版アニメーション第2弾。雪が降り続く冬のある夜。ヒーロー社会を壊そうと目論むヴィラン・死柄木弔たちが、密かに何かを運ぼうとしていた。彼らの動きを事前にキャッチしたプロヒーローたちが現場に駆け付け、激しい戦いを繰り広げる。ちょうどその頃、出久たち雄英高校ヒーロー科1年A組の面々は、引退したNo.1ヒーロー・オールマイトの後を継ぐ“次世代のヒーロー育成プロジェクト”の一環として、クラス全員で期間限定の校外ヒーロー活動のために日本のはるか南に位置する離島・那歩島を訪れていた。ここしばらく大きな事件が全く起きていない平和な島で、駐在ヒーローとして島民の生活を助けながら過ごしていたが、突如謎のヴィランたちが島に襲来、次々と島の施設を破壊していく。それを指揮するのは、「ナイン」。出久、爆豪ら1年A組のメンバーは力を合わせてヴィランに立ち向かうが、ナインの圧倒的な“個性”と力は想像を遥かに超えるものだった......。